Аналіз на рнк коронавірусу является ключевым компонентом понимания, диагностики и, в конечном итоге, контроля над пандемией COVID-19. Во время этих беспрецедентных глобальных усилий по изучению вируса и работе по его сдерживанию анализ генетического материала вируса сыграл неотъемлемую роль.
Что за анализ?
РНК означает рибонуклеиновую кислоту, и это генетический материал коронавируса, известного как SARS-CoV-2. Этот вирус является частью семейства РНК-вирусов, известных как коронавирусы, и может показаться, что он похож на другие вирусы по симптомам, но из-за специализированного характера анализа РНК каждый штамм дифференцируется и изучается соответствующим образом. Важные компоненты вируса, такие как белки, сайты связывания рецептора клетки-хозяина и другие взаимодействия хозяина и вируса, определяются путем анализа молекулы кРНК.
Анализ генетического материала коронавируса стал возможен благодаря сочетанию усовершенствованных технологий секвенирования и готовности многих исследовательских лабораторий сотрудничать в попытке понять SARS-CoV-2. Для идентификации конкретных участков вирусного генома использовались различные методы секвенирования с коротким и длинным считыванием, а полученные данные можно использовать для сравнения и противопоставления различных штаммов вируса. Например, считается, что различия в последовательностях белков шипов вируса объясняют трансмиссивность штамма SARS-CoV-2.
В дополнение к преимуществам существующих методов секвенирования исследователи определили новые методы, специально применимые к коронавирусу. К ним относятся такие методы, как мультиплексное глубокое секвенирование и пангеномный анализ. Мультиплексное глубокое секвенирование позволяет захватывать и секвенировать несколько областей вирусного генома, что необходимо для правильного изучения истории эволюции вируса, генотипического разнообразия, патогенеза и многого другого. Пангеномный анализ включает синтез генетических данных нескольких штаммов вируса, чтобы лучше понять общее генетическое разнообразие вируса.
В целом, анализ РНК коронавируса абсолютно необходим для лучшего понимания вируса и определения ответных мер медицинских работников, правительств и сообществ во всем мире. Широта и сложность знаний, полученных в результате этого анализа, ошеломляют и, несомненно, помогут определить стратегии, используемые для сдерживания вируса и защиты людей во всем мире.